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scENVI:通过协方差环境定义细胞生态位及利用ENVI整合单细胞与空间组学数据 || Nature Biotechnology 审核中
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综述:应用单细胞和单核基因组学研究神经系统中的细胞异质性和细胞命运变化 || Nature Neuroscience 审核中
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基因选择方法影响单细胞RNA测序数据整合和查询的性能 || Nature Methods 审核中
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综述:单细胞基因组学和空间分辨基因组学方法在神经科学研究中的机遇与挑战 || Nature Neuroscience 审核中
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NicheCompass:用数字解码空间多组学数据的细胞生态位 || Nature Genetics 审核中
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TensionMap:空间机械(机械力,如细胞压力或张力)转录组学(基因表达)的计算框架 || Nature Methods 审核中
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Cell2fate:通过推断RNA速率模块来提升细胞命运预测能力 || Nature Methods 审核中
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Spotiphy:一种实现单细胞分辨率与全基因组覆盖的空间转录组学新工具 || Nature Methods 审核中
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提高Xenium In Situ数据的实用性:通过质量评估和最佳实践分析流程 || Nature Methods 审核中
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PS:解码异质性单细胞扰动的响应 || Nature Cell Biology 审核中
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arXivLabs || AI驱动的三维空间转录组学 || 3D-ST 审核中
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Cell || Open-ST:高分辨率的三维空间转录组学 审核中
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SQANTI3:用于准确识别已知和新型异构体的全长转录组分析 || Nature Methods 审核中
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Evo 2:跨越所有生命领域的基因组建模与设计 审核中
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CellHint:自动协调和整合不同人类细胞图谱数据集中的细胞类型 || Cell || RSOURCE 审核中
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