三阴性乳腺癌HRD和非HRD中肿瘤微环境的差异

小伙伴们大家早上好，今天小编和大家分享的这篇文章是近期发表在《Computers in Biology And Medicine》（IF:7.7）,本篇文章主要对三阴性乳腺癌(TNBC) 同源重组缺陷(HRD)和非HRD进行了比较TNBC是乳腺癌侵袭性最强的亚型，其HRD比例最高。HRD一直被认为是免疫检查点抑制剂(ICIs)反应的生物标志物，对HRD和非HRD TNBC样本的肿瘤微环境(TME)进行综合比较可能是有帮助的。今天让我们一起来学习一下这篇文章吧！1.HRD和非HRD样本单细胞图谱数据：GSE161529：包括4个HRD和4个非HRD样本的单细胞测序数据；TCGA下载体细胞突变谱、FPKM类型的转录组数据以及乳腺癌和卵巢癌患者的临床特征（图1A）。对8个TNBC样本的单细胞数据进行分析，通过质量控制和细胞注释，标记基因识别出上皮细胞、免疫细胞和基质细胞。免疫细胞初步分为T/NK细胞、B/浆细胞、髓系细胞、浆细胞样树突状细 ………………………………