如何寻找已发表的单测数据整合到科研项目

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点击 蓝字 关注我们 在老师们进行多组学联合分析时，可能由于样本数量不足或其他原因，需要利用公共数据库中的单测数据与我们自己的组学数据进行联合。为了进行这种分析，通常需要获取原始的组学测序下机数据，这就涉及到如何在数据库中找到并下载这些原始数据。 今天小编重点介绍两个数据库的数据查找，分别是美国NCBI下属的GEO数据库和中国生物信息中心的GSA数据库。 GEO数据库 01 数据库介绍 • GEO (Gene Expression Omnibus) 是由美国国立卫生研究院 (NIH) 下属的国家生物技术信息中心 (NCBI) 维护的一个公共数据库，用于存储和共享高通量基因表达数据。GEO 数据库涵盖了各种类型的基因表达数据，包括微阵列数据、高通量测序数据、蛋白质组学数据等。 • GEO数据库主要储存高通量基因表达数据。如果需要获取原始的测序数据，则需要链接 ………………………………