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不想做传统孟德尔随机化的,就赶紧做这种热点风口的数据挖掘吧!

生信狂人团队  · 公众号  ·  · 2024-08-15 10:05
    

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今天分享一篇二区的可用药基因组学数据挖掘SCI,这篇文章发表在 Respiratory Research (影响因子:4.7)上,使用的是可用药基因的eqtl和pqtl数据,没有补任何实验。 分析步骤、思路: 1、可用药基因的搜索 2、可用药基因的eqtl、pqtl数据下载 3、利用MR批量(eqtl)筛选阳性结果的可用药基因 4、利用共定位进一步批量筛选可用药基因 5、pqtl数据进行验证 可用药基因的搜索与下载 可用药基因eqtl数据的下载、整理、过滤 MR(eqtl)批量筛选阳性结果的可用药基因 批量共定位进一步筛选阳性结果的可用药基因 pqtl数据进行验证 整理一下结果就可以发表了 这里比较难的就是eqtl数据的整理,如果没有比较好的电脑,是处理不了 ,同时也对统计学熟悉才可以转换得到beta、se,对电脑编程能力要求比较高,需要将每一个基因的eqtl数据单独保存到一个文件,可以进 ………………………………

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