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支持 Seurat.V5!最新的【R & Python】单细胞数据转换工具~

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-11-27 08:00

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ easySCF 一种旨在增强 R 和 Python 之间单细胞数据互操作性的工具 通过支持无缝数据交换( HDF5 作为中介 ), easySCF 提高了单细胞数据 分析的效率和准确性 。 为什么选择 easySCF easySCF 使用统一的数据格式(.h5 格式)来促进 R 和 Python 平台之间的数据传输 。该工具已针对数据 处理速度、内存效率和磁盘使用率 以及处理大规模单细胞数据集的能力进行了评估。 面对 最新版本的 Seurat v5、大规模数据( eg:上百万的细胞 )和空间转录组 数据,现有的数据格式转换包不太适合实际的数据分析过程。 数据转换示意图 为了解决这个问题并更好地利用 Seurat 和 Scanpy 的不同数据格式,研究人员开发了一种数据格式转换工具,允许研究人员在 Seurat 和 Scanpy ………………………………

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