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IF40+泛癌分析 单细胞和空间转录组揭示成纤维细胞肿瘤微环境

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-03-11 07:00
单细胞和空间转录组结合的泛癌分析长什么样,今天带大家看一看。1.研究背景          肿瘤表现出广泛的异质性,癌细胞与其微环境_相互作用,形成一个复杂的生态系统。泛癌相关的成纤维细胞(CAFs)作为肿瘤微环境(TME)最突出和最丰富的细胞群之一,近年来引起了人们的极大关注。CAF与基质组分和免疫细胞的复杂相互作用在协调TME重组中起着至关重要的作用,包括血管生成、细胞外基质(ECM)重塑和免疫逃避等过程。目前,包括免疫治疗和化疗在内的大多数治疗方法在很大程度上忽视了CAFs的关键作用。近年来,单细胞转录_组学的应用揭示了许多癌症类型中CAFs的异质性,但组织分离过程中空间信息的丢失阻碍了对CAFs和TME关系的研究。因此,作者将scRNA-seq数据与ST数据进行正交整合将有助于确定CAFs的空间分布特征,并进一步剖析CAFs与TME之间的细 ………………………………

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