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专栏名称: 生信修炼手册
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HPA:人类蛋白图谱数据库

生信修炼手册  · 公众号  ·  · 2019-07-04 19:38
欢迎关注”生信修炼手册”!HPA全称是Human Protein Atls， 利用转录组学和蛋白质组学技术，从RNA和蛋白水平研究人类不同组织和器官中的蛋白表达情况，网址如下https://www.proteinatlas.org/根据32个不同组织中蛋白编码基因的RNA_seq数据，将基因进行了分类，结果如下所示鉴于分泌蛋白，膜相关蛋白在病理生理学中的重要作用，将蛋白划分了下图所示的不同类别进行研究通过不同组织中的RNA_seq数据，分析了蛋白编码基因在不同组织中的富集情况，如下所示可以看到在脑组织中，膜香瓜蛋白较多，而在肺中，分泌蛋白较多。除了对不同组织/细胞中的蛋白表达进行比较分析，还进一步研究了不同肿瘤中蛋白的表达情况。在HPA中，又进一步划分成了以下3个子类1. The  Tissus Atlas用于查 ………………………………

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