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“生信零代码”时代来临:Cell的分析照样零基础做

谷粉学术  · 公众号  · 科技自媒体  · 2024-10-20 08:19
    

主要观点总结

本文介绍了生物信息学(生信)的火热程度,通过TCGA数据库为例展示了生信在临床科研中的应用。文章还提到了不会R语言或代码的人如何利用生信提高科研效率,以及一个名为“科研者之家”的平台提供的生信零代码版块,该平台整合了多个公共数据库,提供强大的样本筛选功能和分析模块,方便科研人员进行生物信息学分析。

关键观点总结

关键观点1: 生物信息学的火热程度及其实用性

文章通过TCGA数据库的例子展示了生物信息学在临床科研中的广泛应用,以及其对科研效率的提升。

关键观点2: 生信在科研中的应用挑战

许多科研者面临不会R语言或代码的挑战,导致无法充分利用生信提高科研效率。

关键观点3: “科研者之家”平台的介绍及其功能

介绍了“科研者之家”平台上的生信零代码版块,该平台整合了多个公共数据库,提供强大的样本筛选功能和分析模块,方便用户进行生物信息学分析,并且分析结果可与R语言分析结果相当。

关键观点4: 平台的特点和优势

平台具有强大的样本筛选功能、多种分析模块、高清矢量图生成、原始数据下载、图文对照、方法学和结果的中英文对照以及参考文献等特点和优势,极大方便了科研人员进行课题设计和论文写作。


文章预览

作为科研者,如果你到现在还不知道 生物信息学 ,那真的太out了,生信有多火?拿最有名的数据库TCGA( Cancer Genome Atlas )来说, 目前已经收录了来自1万多例病人的33种癌症的数据,2.5PB的数据量。 在pubmed中随便搜一个TCGA,就可以发现近年来相关文献发表量在成指数级增长。 这其中,一部分是利用TCGA数据库发表的纯生信文章,比如 2018年4月 发表在Cell上的一篇 “ Comprehensive Characterization  of Cancer Driver Genes and Mutations ”。 也有很多利用TCGA数据库的图片给文章增色的, 比如 2019年3月4,耶鲁大学 陈列平 教授团队在 Nature Medicine 上发表题为 Siglec-15 as an immune suppressor and potential target for normalization cancer immunotherapy  的文章,里面就利用TCGA数据库分析了Siglec-15 和T cell signature genes (CD3E, IFNG, GZMA and GZMB) 在膀胱癌中的关系。 而这些都不需要额外的湿实验,大 ………………………………

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