专栏名称: 生信技能树
生物信息学学习资料分析,常见数据格式及公共数据库资料分享。常见分析软件及流程,基因检测及癌症相关动态。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信技能树

每个样品搞这么多细胞干什么啊(这样谁相信你的数据分析结论?)

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-08-06 11:51

文章预览

交流群有小伙伴分享了一个新鲜出炉的2024的单细胞转录组配合空间单细胞的文献:《Single-cell and spatial transcriptomics analysis of non-small cell lung cancer》,可以看到这个研究的细胞数量还是很可观的,接近100万啦 : 503,549 were from tumour 392,257 from combined background and healthy tissue 但是实际上的病人数量并不多:lung tissue resections from 25 treatment-naive patients with either LUAD (n = 13), LUSC (n = 8) or undetermined lung cancer (LC, n = 4), and two healthy deceased donors 也就是说这25个病人每个人都是癌症和癌旁两个样品 :We collected both tumour and matched normal non-tumorigenic tissue (i.e., background), isolated CD45+ immune cells  ,总计50个左右的样品居然有90多万个细胞数量,相当于是每个样品都是两万多的细胞数据啦。但是每个样品搞这么多细胞干什么啊? 探究一下这个单细胞转录组数据集是E-MTAB-13526 可以很 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览