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Nat Methods:我国学者比较 11 种空转技术

丁香学术  · 公众号  ·  · 2024-08-06 17:05

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高通量测序技术的出现彻底改变了转录组学,为基因表达的复杂性提供了无与伦比的见解。 空间转录组学(spatial transcriptomics,sST) 作为一门新兴的学科,通过高通量测序技术揭示了基因表达在组织空间中的分布,对于理解细胞异质性、组织结构和细胞间相互作用具有重要意义。然而,由于 sST 技术平台的多样性和复杂性,目前尚缺乏对不同平台进行全面基准测试的研究。 图 1:相关研究(图源: Nature Methods ) 2024 年 7 月 4 日,广州国家实验室田鲁亦团队联合西湖大学刘晓东团队在 Nature Methods 杂志上发表了文章「Systematic comparison of sequencing-based spatial transcriptomic methods」。研究者通过建立一组具有明确组织学结构的参考组织和区域, 对 11 种 sST 技术进行了系统的比较分析,不仅强调了分子扩散作为不同方法和组织的可变参数,显著影响了有效分 ………………………………

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