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“生信零代码”时代来临:Cell的分析照样零基础做

谷粉学术  · 公众号  ·  · 2024-07-01 08:19
作为科研者,如果你到现在还不知道生物信息学,那真的太out了,生信有多火?拿最有名的数据库TCGA(Cancer Genome Atlas)来说,目前已经收录了来自1万多例病人的33种癌症的数据,2.5PB的数据量。在pubmed中随便搜一个TCGA,就可以发现近年来相关文献发表量在成指数级增长。这其中,一部分是利用TCGA数据库发表的纯生信文章,比如2018年4月发表在Cell上的一篇“Comprehensive Characterization of Cancer Driver Genes and Mutations”。也有很多利用TCGA数据库的图片给文章增色的,比如2019年3月4,耶鲁大学陈列平教授团队在Nature Medicine上发表题为Siglec-15 as an immune suppressor and potential target for normalization cancer immunotherapy 的文章,里面就利用TCGA数据库分析了Siglec-15 和T cell signature genes (CD3E, IFNG, GZMA and GZMB) 在膀胱癌中的关系。而这些都不需要额外的湿实验,大大提高了临床医生 ………………………………

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