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从NC中学习利用单细胞多基因负荷评分识别细胞类型

作图丫  · 公众号  ·  · 2024-11-14 08:00
    

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最近有小伙伴反映收不到推送,因为公众号改了推送算法,现在需要加星标,多点赞、点在看,才能准时收到推送哦。      极度近视(EM)定义为球形等效(SE)≤−10.00屈光度(D),是视力障碍的主要原因之一。已知的 EM 相关变异只能解释有限的风险,不足以进行临床决策。为了发现风险基因,我们对449名EM个体和9606名对照进行了全外显子组测序(WES)。我们在EM病例中发现罕见的蛋白质截短变体(PTV)显着过量,富含逆行囊泡介导的运输途径。采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单细胞多基因负荷评分(scPBS),我们将PI16 + / SFRP4 +成纤维细胞确定为最相关的细胞类型。我们观察到 KDELR3 在巩膜成纤维细胞中高度表达并参与巩膜细胞外基质(ECM)组织。斑马鱼模型显示,kdelr3 下调导致眼轴长度延长和晶状体直径增加。总之,我们的研究提供了对人 ………………………………

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