上海交大吴强团队《自然·通讯》：揭示三维基因组拓扑相关结构域边界的CTCF组织规律

基因组三维结构影响基因复制、修复、转录和重组等最基本的生命活动，决定着细胞分化、组织发育和器官发生，它的异常将引起复杂精神疾病、肿瘤、先天性畸形、早衰和自身免疫性疾病等。人类2米长的基因组DNA缠绕成“串珠”样的核小体，经环化形成数千个拓扑相关结构域（TAD），从而有序地折叠在微米级的细胞核内发挥功能。CTCF蛋白在基因组DNA环化中发挥关键作用。线性基因组中正向与反向的CTCF结合位点在立体空间上相互靠近形成染色质环，因此基于染色质环化形成的TAD边界中总是分布着朝向TAD内的CTCF结合位点1-3。然而，多数TAD边界中还分布着朝向TAD外的CTCF结合位点，他们点缀在成簇的CTCF位点中是否以及如何发挥生物学功能尚属未知。2023年12月7日，上海交通大学系统生物医学研究院比较生物医学中心吴强团队在Nature子刊Nature Communications ………………………………