SpatialExperiment || 空间数据管理

作者 |  周运来男，一个长大了才会遇到的帅哥，稳健，潇洒，大方，靠谱。一段生信缘，一棵技能树。生信技能树核心成员，单细胞天地特约撰稿人，简书创作者，单细胞数据科学家。我们知道单细胞数据的激增和它的高维特征催生了针对单细胞数据的数据格式：Seurat对象、singlecellexperiment对象以及anndata对象。空间数据的出现为表达量数据带来了新的视角，一般它包含图像数据，空间坐标数据以及表达量数据。虽然以上三种数据格式可以轻松地把空间信息包装起来，但是为了凸显空间位置的重要性，人们开发了与单细胞的singlecellexperiment类似的SpatialCellExperiment用于空间数据管理与分析。当然，另一个R包：SpatialExperiment 也在不断地完善中。那么，我们不禁要问为什么之 ………………………………