热图到底是横向基因层面归一化还是依据纵向的样品呢？

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看到了一个2022的文章，标题是：《Bromodomain Inhibitors Modulate FcgR-Mediated Mononuclear Phagocyte Activation and Chemotaxis》。这个研究里面的转录组数据是通过RNA测序（RNA-seq）技术获得的，这些数据来自两个不同的细胞类型：树突细胞（Dendritic Cells, DCs）和巨噬细胞（Macrophages），以及它们在不同实验条件下的反应。 不同的细胞类型就是不同的数据集，每个数据集内部都是4个分组： IC（Immune Complexes）刺激 ：树突细胞被免疫复合物刺激，这是模拟体内免疫反应的一种实验条件。 Ova（Ovalbumin）刺激 ：树突细胞被卵清蛋白刺激，这是一种常用的模型抗原，用于研究免疫细胞的激活。 DMSO对照组 ：细胞未接受任何处理，DMSO是iBET药物的溶剂，这里作为阴性对照。 iBET处理组 ：细胞被BET蛋白抑制剂iBET处理，用于研究iBET对树突细胞转录组的影响。 在（Gene Expression Omnibus, G ………………………………