专家点评Nat Methods | 王潇团队开发空间组学跨技术、跨样本的数据整合和比较分析算法

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点评 | 任仙文 （昌平国家实验室） 、 高歌 （北京大学） 空间转录组 （Spatial Transcriptome） 被《Nature Methods》杂志评为2020年年度技术。这项前沿技术可以同时检测细胞空间信息和细胞内的基因表达。随着空间组学的发展，除了传统的基因转录组表达量外，现有的技术还能够捕捉不同的模态，如翻译组和蛋白质组。然而，由于空间组学数据存在各种类型的差异，如测序技术、样本、分辨率、捕获覆盖面积或者基因集合的不同，如何整合和比较分析不同空间组学数据是该领域亟待解决的难题。 2024年9月18日，MIT麻省理工学院和 Broad 研究所的 王潇 团队在 Nature Methods 杂志发表了题为 Search and match across spatial omics samples at single-cell resolution 的研究论文。该研究提出算法 CAST ，创新性地 利用深度图神经网络捕捉不同空间组学数据间相似的空间特征，并利用其 ………………………………