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一文了解如何利用同源建模预测蛋白质三级结构

生化实验室  · 公众号  ·  · 2018-01-01 10:44
上图为常见的Lysozyme 3D结构图(Photo credit to Dr Jon Heras, CGSociety, 侵删)已知蛋白质的一级序列,如何能够获得其三级结构呢?结构生物学领域的科学家们能够利用扫描电镜,核磁共振以及X衍射等手段获得绝大多数蛋白质的结构。但解析蛋白质结构毕竟是一个专门的领域,对于“门外汉”,同时又没有资金委托他人来解析结构的研究者来说,就只能自己预测了。预测分为从头预测和同源建模。同源建模预测的准确度高于从头预测,尽管依然没有真实测定来的准确。通过对预测结构的分析, 是可以获得很多信息的,比如解释酶的催化机理或者预测蛋白质的突变位点, 推断蛋白质结构与功能的关系等等。那么如何利用同源建模来预测蛋白质的三级结构呢?同源建模的原理 ………………………………

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