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(终篇)当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2024-06-26 07:30
    

主要观点总结

本文介绍了从药物干预的角度确定研究主题的过程,以微信公众号“星标小张聊科研”的文章内容为例,详细阐述了如何从RNA-Seq数据中挖掘出与脑卒中相关的课题,并结合文献分析进行了验证。本文的主题讨论了代谢和细胞骨架两个方面,以及药物对于巨噬细胞的招募过程的影响等话题。

关键观点总结

关键观点1: 药物干预的角度确定研究主题的过程介绍

通过筛选过血脑屏障的药物,找到相关的化合物及其靶点,进而从基因和功能角度建立药物与脑卒中的联系。

关键观点2: 代谢和细胞骨架作为研究主题的选择依据

通过文献分析和数据筛选,确定了代谢和细胞骨架两个研究方向,并探讨了与脑卒中的关系。

关键观点3: 巨噬细胞招募过程中的细胞骨架作用分析

通过文献分析发现巨噬细胞迁移与细胞骨架蛋白的关系,探讨了药物影响巨噬细胞迁移的潜在机制。

关键观点4: 课题设计的思路和方法

从差异基因和功能富集结果出发,结合KEGG Pathway和GO条目确定研究主题,利用数据库工具和文献分析进行课题设计。

关键观点5: 科研探索过程中的挑战和快乐

文章体现了科研探索过程中的波折和思考过程,强调了即使在一个热点领域,也能通过选准角度发掘新的问题。


文章预览

微信公众号又改版啦, 星标小张聊科研,关注更多科研推文! 这是这个主题的第四期,前面三期分别见链接: 当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的(1)?——炎症、抗炎策略和神经元细胞焦亡 (二)当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的(2)?——从吞噬体到细胞自噬、胞葬作用和吞噬作用的靶向性; (三)当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的3.(3)?——高尔基体功能障碍影响星形胶质细胞外泌体特征; 本期我们说最后1个课题思路:从药物干预的角度确定研究主题。 5. 从药物出发确定研究主题 这次我从过血脑屏障的药物出发来设计,这点我想就不用多解释了。 首先我找到过血脑屏障的600多个小分子化合物 (图1) : 图1 这些化合物的靶点归类到不同的功能和通路上 (图2) : 图2 ………………………………

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