超400病人的临床实验结果还需要生信验证

生信技能树 · 公众号 · · 2024-09-04 19:21

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我们的生物信息学马拉松授课的一个最重要的环节就是表达量矩阵数据处理，其中让大家练习最频繁的就是传统的表达量芯片的差异分析和富集分析啦。其中有一个学员是临床医师，感兴趣的是胃肠道间质瘤（Gastrointestinal Stromal Tumor）这个疾病，但是他在复现一个芯片数据的时候，发现了临床实验结果和表达量芯片数据出现了冲突！我们首先让人工智能大模型帮我们介绍一下，胃肠道间质瘤（Gastrointestinal Stromal Tumor）这个疾病：是一种发生在胃肠道的软组织肉瘤，通常起源于胃肠道的间质细胞（Cajal细胞）。这些肿瘤可以发生在消化道的任何部位，但最常见于胃和小肠。GIST的治疗和预后因其生物学特性和临床行为的多样性而复杂。比如仁济医院的2014的文章：《CTHRC1 Acts as a Prognostic Factor and Promotes Invasiveness of Gastrointestinal Stromal Tumors by Activating Wnt ………………………………

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