专栏名称: 生信技能树
生物信息学学习资料分析,常见数据格式及公共数据库资料分享。常见分析软件及流程,基因检测及癌症相关动态。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信技能树

公共数据集已经成为了生命科学研究的高速公路

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-09-23 18:25

文章预览

我们的生物信息学马拉松授课的一个最重要的环节就是表达量矩阵数据处理,其中让大家练习最频繁的就是传统的表达量芯片的差异分析和富集分析啦。 有一个学员提到了一个简单的两分组的表达量芯片数据分析细节问题: tumor and paired non-tumor tissue of HCC patients. 因为单一的数据集里面有两个不同的表达量芯片平台: GPL571 [HG-U133A_2] Affymetrix Human Genome U133A 2.0 Array GPL3921 [HT_HG-U133A] Affymetrix HT Human Genome U133A Array 链接是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE14520 我简单的点击看了看,居然被关联到了十几篇文献: 被关联到了十几篇文献 我们随意点击其中一个:Elafin promotes tumour metastasis and attenuates the anti-metastatic effects of erlotinib via binding to EGFR in hepatocellular carcinoma. J Exp Clin Cancer Res 2021 Mar 26;40(1):113. PMID: 33771199,可以看到作者关心的是: E ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览