生信数据分析可靠与否是一个伪命题

文章预览

多种场合我都是高举生物信息学数据分析的靠谱的大旗，详见前面的推文： 离大谱了，生信转湿实验？ 。仍然每次跟网友们的讨论的结局都是一地鸡毛，大家总会是把生物信息学数据分析跟常见的临床数据挖掘预后模型那些水文混为一谈。 最简单的一个生物信息学数据分析案例，可以是针对一个表达量矩阵以及里面的样品分组进行差异分析，然后拿到统计学显著的上下调基因列表，因为基因数量很多，所以我们默认会做一些生物学功能数据库注释。这里面的生物信息学算法就差异分析和注释算法， 它本身是非常可靠的！ 数据分析有错是基本上不可能的，基本上都是新手才会翻车，比如表达量矩阵的格式，是否取多次log会影响变化倍数这个指标，以及上下调弄反的，而且这些错误很容易检验，不存在实验室和地理位置特异性。抛开这个不谈，但 ………………………………