用小提琴图来可视化基因差异表达之美化过程

为了表示基因在样本中的差异，对于许多个基因的话用火山图感觉挺高大上的，那么对于少数几个基因的话一般用什么来展示其表达差异呢，有很多种办法，比如箱线图，柱状图等等，今天主要用小提琴图来可视化几个基因的差异表达。首先安装R包source("https://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite('vioplot')然后我的数据是一个矩阵，行为样本列为基因如：已经知道癌症样本和正常样本的索引那么绘制小提琴图的简单办法如下：vioplot(sigData[tumor,1]    ,sigData[normal,1]    ,sigData[tumor,2]    ,sigData[normal,2]    ,sigData[tumor,3]    ,sigData[normal,3]    ,sigData[tumor,4]    ,sigData[normal,4]    ,names=rep(c("Tumor","Normal"),4),col="red")从图中可以看出这四个基因其实在癌与癌旁是有差异的，但是好丑，很 ………………………………