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代码分享|| 单细胞上车尤未晚!囊括了单细胞分析方方面面包括大类注释、亚群分析、细胞通讯、轨迹分析、生存、多因素cox分析等

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-07-11 08:15

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本次分享的文献是一篇 2024年3月份发表在NC上 的单细胞转录组数据分析非常详细文献!!! 此文献囊括了 单细胞分析的方方面面,包括亚群大类注释,亚群分析,细胞通讯分析,轨迹分析,差异分析,生存分析,多因素cox分析,基因打分等! 单细胞此次上车还不晚,快来学习! unset unset 数据和代码 unset unset bulk RNA-seq : GSE173855 处理后的单细胞数据 : GSE18873725, GSE18222726, and GSE234933 原始单细胞数据 :GSA HRA004648 https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/browse/HRA004648 代码: https://github.com/hedyBao/HNSCC_scRNA/tree/main 可以看到作者将每一步骤的分析代码都整理好了: 亚群大类注释,亚群分析,细胞通讯分析,轨迹分析,差异分析,生存分析,多因素cox分析,基因打分等 基本上都囊括进来了,用此篇文献作为单细胞学习再好不过了~ image-20240616140058834 Single cell deciphering of p ………………………………

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