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Nature immunology:解析肿瘤微环境遗传效应图谱

immunity速读  · 公众号  ·  · 2024-09-03 18:08
    

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昨天,武汉大学缪小平、田剑波共同通讯在《 Nature immunology 》发表 resource “ An atlas of genetic effects on cellular composition of the tumor microenvironment ”,提供了对基因对癌症发病机制和免疫治疗的关键方面肿瘤微环境( TME )影响的全面分析。该研究采用单细胞 RNA 测序( scRNA-seq )来消除肿瘤组织中的细胞组成,揭示了 23 种癌症类型的免疫定量特征基因座( immunoQTL )的详细情况,识别了调节 TME 细胞组成的遗传变异,从而深入了解癌症中遗传和免疫系统之间的复杂相互作用。 不同癌症类型的免疫 QTL 的系统景观突出了这些遗传变异的调节潜力。研究发现,免疫 QTL 富含活性组蛋白标记,表明它们在基因表达调控中的作用。这一发现强调了了解遗传变异如何影响 TME 内免疫细胞的重要性。 免疫 QTL 的功能特征进一步确定了它们的调控特性,其中很大一部分与 ………………………………

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