Nat Commun | 单细胞水平检测染色体外环状DNA多样性及复杂性的新工具scCircle-seq

导读染色体外环状DNA（eccDNA）是一类游离于染色体外的环状DNA，广泛存在于包括人类的各种真核生物中，参与调控基因的表达、细胞增殖、DNA损伤修复、肿瘤发生等多个生物学过程；其不易被核酸酶降解，结构更加稳定。目前，研究eccDNA主要方法有DNA荧光原位杂交（FISH）、批量全基因组测序（WGS）和Circle-Seq三种。前两种方法只能检测来自相对较大的基因组区域丰富的eccDNA，Circle-Seq能够识别广泛的eccdna但需要较大数量的细胞进行测序分析。 因此，目前亟需开发通用、可扩展的方法来检测从组织活检中提取的单个细胞或细胞核中的eccDNA，以揭示eccDNA的生物学复杂性，并阐明其在患者来源肿瘤样本中的异质性。近日，瑞典卡罗林斯卡医学院的科研人员在Nature Communications杂志发表了题为“scCircle-seq unveils the diversity and complexity of extrachromosomal circular DNAs in ………………………………