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Science | 颠覆传统基因组结构变异研究:Genome-Shuffle-seq的高效生成与精确检测

生物探索  · 公众号  · 生物  · 2025-02-04 15:30
    

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引言 在基因组学的研究中,结构变异(Structural Variants, SVs)一直是一个备受关注却又充满挑战的领域。与常见的单核苷酸变异(Single Nucleotide Variants, SNVs)和小型插入缺失变异(indels)相比,SVs的研究面临着诸多难题。SVs指的是基因组中大于50个碱基对的变异,包括缺失、重复、倒位、易位等形式,这些变异往往能够显著影响基因功能、基因表达及细胞的整体健康。然而,SVs的研究在以往主要依赖于一些较为有限的方法,这些方法通常效率低下且成本高昂。 为了克服这一挑战,1月31日 Science 的研究报道“ Multiplex generation and single-cell analysis of structural variants in mammalian genomes ”,研究人员开发了 Genome-Shuffle-seq 这一创新性技术,旨在通过一种简便且高效的方式,在哺乳动物基因组中进行大规模的SV生成、标记和检测。这一方法的最大亮点在于其能在单 ………………………………

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