如何判断并量化通路上下调 (up or down)？

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生信益站，一点就有益 ！ 祝友友们天天开心，月月发 CNS~ 设我为🌟星标，每天就能第一时间看到推送啦~ ❝ 事情是这样的，有友友在问 KEGG通路【上下调】的判断方法 ，于是便有了此文。 0 引言 那就给大家画个 图吧 —— 用以 朴素展示【富集到的通路中】【上下调基因 数量 】的关系—— up>down、up 进而去量化通路的上下调 。样子如下： 这种图我在网上找到的最早的出处 来自https://thef5.substack.com/p/how-to-comet-plot。 人家叫彗星图，所以我就也叫彗星图啦 （你想叫流星图也可以）。 ❝ 其实绘制 彗星图 的关键就是使用 ggforce 包。接下来就给大家展示彗星图的绘制方法（ 记得加载tidyverse和ggplot2包 ）。 1 数据来自 GOplot 包 为啥用这个包？ 因为这个包 本身就有计算 up/down 关系（zscore ）的功能，而且还提供了可视化函数。 第 一 个输入文件就是 富集 ………………………………