常见的数据格式及数据库The learning notes of the biostar handbook(4)

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常见的数据格式 genbank genbank是美国国立卫生研究院维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个记录代表了一个单独的、连续、带有注释的DNA或RNA片段。 文中关于埃博拉病毒的例子 特点： 易读性，便于信息交换 不利于计算机进行数据分析 可通过RefSeq进行格式转化 FASTA格式 在生物信息学中，FASTA格式是一种用于记录核酸序列或肽序列的文本格式，其中的核酸或氨基酸均以单个字母编码呈现。该格式同时还允许在序列之前定义名称和编写注释。这一格式最初由FASTA软件包定义，但现今已是生物信息学领域的一项标准。（来源维基） 格式 FASTA格式中的一条完整序列，包含开头的单行描述行和多行序列数据。描述行行首前置半角大于号 ………………………………