专栏名称: 生信分析手册
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细胞焦亡联合单细胞,可作学习!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-11-22 17:52

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Combined analysis of bulk RNA and single-cell RNA sequencing to identify pyroptosis-related markers and the role of dendritic cells in chronic obstructive pulmonary disease”,这篇文章发表在 Heliyon 期刊上,影响因子为3.4。 结果: 与焦亡相关的 DEGs 的获取和富集分析 本研究的总体流程图如图 1 所示。首先,作者对 GSE76925 数据集中的转录组数据进行了差异表达分析。图 2A 和 B 显示了在差异表达分析期间获得的热图和火山图。热图显示,患病组和对照组 DEGs 的表达差异显著。最后,确定了 8219 个 DEGs。作者从文献中获得了 110 个 PRG,然后将它们与 DEGs 相交。最后,鉴定出 35 个交叉基因(图 2C)。如图 2D 所示,两组之间 35 个基因的表达差异显著。最后,作者分别展示了图 3A 和 B 中交叉基因的 KEGG 富集分析和 Metascape 富集分析的结果。在第 IV 节中 ………………………………

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