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胡璐璐/刘杰/何川等团队合作开发定量检测超微量样本中核酸表观修饰的新方法LAMP-MS

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-11-08 15:03

主要观点总结

本文报道了关于《LAMP-MS for Locus-Specific Visual Quantification of DNA 5mC and RNA m6A Using Ultra-Low Input》的研究论文,该论文介绍了由复旦大学医学院胡璐璐研究员团队等共同完成的新方法LAMP-MS。该方法结合了液体活检技术和多重PCR技术,能够同时检测数十个甲基化位点,具有革命性的优势。研究还验证了LAMP-MS方法在癌症早期诊断、预后监测和疗效评估等方面的应用价值。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及重要性

液体活检技术通过收集血液中的游离DNA(cfDNA)进行生物标志物检测,具有无创、高效的特点。DNA甲基化是肿瘤液体活检中的生物标志物,但现有检测方法存在成本高、操作复杂等问题。因此,开发一种成本低、中通量且可靠的新检测方法具有重要意义。

关键观点2: LAMP-MS技术的特点

LAMP-MS技术结合了线性扩增和飞行时间质谱技术,能够在短时间内同时检测数十个甲基化位点。该方法具有可视化、准确度高、灵敏度高等特点,只需要超低量的样本即可进行检测。

关键观点3: LAMP-MS技术的验证及应用

研究团队通过合成DNA探针和真实世界样本验证了LAMP-MS方法的性能,发现该方法可以灵敏地检测DNA甲基化。此外,研究团队还将该方法应用于结直肠癌患者的血浆cfDNA样本检测,并获得了良好的结果。同样的策略还可以拓展到RNA的定量检测中,如m6A修饰的检测。

关键观点4: 研究展望

LAMP-MS技术有潜力成为表观遗传学领域重要的实用工具,为实验室研究和临床样本检测提供广阔的应用前景。


文章预览

2024年11月4日,国际化学类顶级期刊《德国应用化学国际版》( Angewandte Chemie-international Edition )(IF 16.1)上发表了题为《LAMP-MS for Locus-Specific Visual Quantification of DNA 5mC and RNA m6A Using Ultra-Low Input》的研究论文。 该工作由复旦大学医学院胡璐璐研究员团队、华山医院消化科刘杰主任团队、美国芝加哥大学何川院士团队携手柏锘(上海)医疗科技有限公司共同完成。 液体活检技术通过收集血液中来自各种组织的游离DNA(cfDNA),对其中包含的生物标志物(如基因突变、甲基化或羟甲基等表观修饰)进行检测,具有无创、高效的特点。与传统的各种检测技术(例如胃肠镜、血清标志物)相比,液体活检在临床上具有革命性的优势,在癌症等疾病的早筛早诊、预后监测、疗效评估等诸多方面有广阔的应用前景。 DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,可在 ………………………………

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