大麦泛基因组(pan-genome)论文,分析泛基因组的代码都有,很好的学习泛基因组分析的材料

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论文 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.02.14.580266v1 Adaptive diversification through structural variation in barley 论文还没有发表，我感觉大概率会在Nature发表。论文中对泛基因组分析的方法描述很详细，这篇文章里提到构建泛基因组用到的软件是minigraph，论文里写用这个软件的理由是大麦基因组比较大（应该在5个G左右），像PGGP这种软件计算压力会非常大，minigraph只考虑大于50bp的SV，在计算上就会相对容易一些 论文中对应的泛基因组分析的代码 https://github.com/mb47/minigraph-barley 有时间对照着方法描述仔细看代码 欢迎大家关注我的公众号 小明的数据分析笔记本 小明的数据分析笔记本 公众号 主要分享：1、R语言和python做数据分析和数据可视化的简单小例子；2、园艺植物相关转录组学、基因组学、群体遗传学文献阅读笔记；3、生物信息学入门学习资料及自己的 ………………………………