基于tidyomics体系从转录组表达矩阵的分析流程实战

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前言及介绍 由于tidyomics体系对于传统转录组的分析是从bicoductor的SE对象开始的，官网没有介绍常规的表达矩阵与表型数据的后续分析流程，正好昨晚帮一个师妹进行相关的分析，他手里有一个表达自测的表达矩阵数据及表型数据需要进行普通转录组的下游分析，因此再次正好把相关代码分享出来供大家参考。 本次分享内容代码参考网址 https://tidytranscriptomics-workshops.github.io/rpharma2021_tidytranscriptomics/articles/tidytranscriptomics.html#exploratory-analyses-1 方法学参考文献 整体体系流程 数据情况 本次的数据是传统的RNA-seq转录组，分为3个不同的组，为L,H和M，其实H为对照组，后续我们需要将L组和M组均与H组进行差异及富集分析。每个分组进行了3个生物学重复。就是测了3个样品。 表型数据分组情况 表达矩阵 整体分析思路 由于在tidyverse体系下实现所有功能，所以在 ………………………………