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探索scCustomize:提升单细胞数据分析与可视化的利器

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-11-21 09:52
    

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前情提要 前两期推文基于seurat的FeaturePlot进行可视化和美化,在学过程中发现 scCustomize包 在FeaturePlot美化中非常常用 比如在 多元化Featureplot,总有一款适合你 中就 通过scCustomize 实现画多个基因共表达在一张图 以及 scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图,你需要的都在这 中提到 额外安装scCustomize包,该R包对上面提到的Seurat 常用绘图函数进行了一些优化 所以这期基于前辈们整理的推文,一起来探索一下 使用scCustomize 美化FeaturePlot图! scCustomize包简介及安装 scCustomize是一个旨在简化和加速单细胞RNA测序数据分析的工具,它通过提供定制化的可视化、改进的绘图函数、迭代绘图功能、数据导入辅助以及分析简化功能来实现这一目标。 scCustomize已经上传到CRAN,可以直接使用 install.packages("scCustomize") 进行下载,不过在Github上有其详细的使用说明页面 https:/ ………………………………

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