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总有一个适合你的网络图

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2025-01-09 18:00
    

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网络图是展示数据最好的工具,其本质是一系列相互连接的节点和它们之间的相互作用。在生物学中,它常被用来描述复杂的调控机制和寻找核心分子。很多数据也都是符合网络关系的,例如基于string数据库中的蛋白-蛋白互作关系就可以绘制PPI网络图。很多小伙伴问: “我研究的代谢组,用不到string数据库,能画代谢物-代谢物网络图么?” “我研究的全转录组,mRNA和miRNA的相互作用能画网络图么?” “我研究的是转录组+代谢组,能画mRNA和代谢物的网络图么?” 当然可以!为了让大家能够清晰的知道各类网络图的画法,小编将给大家从 网络图的组成 、 绘图数据的准备 以及 绘图工具 给大家进行详细介绍。 1 网络图的组成 网络图由节点和线组成, 节点 就是我们要画的基因/代谢物/蛋白,而 线 则代表他们之间的相互作用(线的长短无特殊含义 ………………………………

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