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无代码快速完成CCA/RDA分析,只需两步

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-10-06 10:59
    

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CCA/RDA分析主要用于物种-环境关系研究,在微生物组学文章中经常见到: BMC Plant Biol . 2024 Fig5 用R包、Python当然可以自力更生做CCA/RDA分析,但能用更省时省力的工具为什么不用~Omicshare平台就有静态CCA/RDA工具及对应支持在线调整的动态CCA、动态RDA工具,上传数据点击提交,简单方便快速出图~ 数据与参数 至少准备2个上传文件,响应变量文件(OUT丰度表)第一行为样本名,第一列为响应变量(ID名称)信息: 解释变量(环境因子列表)文件第一列为样本名,第一行为解释变量(环境因子)信息; 注意做CCA/RDA分析时限制 环境因子的数量要少于样本数 ,即解释变量(环境因子列表)文件列数少于行数; 静态CCA/RDA工具支持上传最多 2种分组 ,第一列样本名,第二、三列为不同的分组,两种分组在图中将以不同的形状、颜色区分; 动态CCA、动态RDA工具则 ………………………………

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