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6+单细胞空转+代谢+实验验证,整合单细胞+空转数据,干湿结合直接盘下!!

生信分析手册  · 公众号  · 医学  · 2025-01-08 18:00
    

主要观点总结

这篇文章探讨了空间转录组学在宫颈癌组织中的应用,揭示了不同肿瘤区域细胞类型的空间分布和代谢差异。研究发现,癌细胞在高代谢区域表现出特定的代谢活性,与周围细胞如成纤维细胞、内皮细胞的相互作用密切。文章还探讨了APP和TRPS1这两个基因在癌细胞代谢中的关键作用,并揭示了它们对癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。文章为宫颈癌的深入研究提供了新的视角和治疗靶点。

关键观点总结

关键观点1: 空间转录组学在宫颈癌组织研究中的应用

通过ST分析,揭示了CSCC组织中不同区域的细胞类型和代谢差异,为理解宫颈癌的肿瘤微环境提供了新视角。

关键观点2: 高代谢区域的特点

研究发现,高代谢区域内的癌细胞表现出较高的代谢活性,与周围细胞的相互作用更为复杂。

关键观点3: APP和TRPS1在癌细胞代谢中的关键作用

揭示了APP和TRPS1对癌细胞增殖、迁移和侵袭的显著影响,并探讨了它们之间的相互作用。这些基因可能成为宫颈癌治疗的新靶点。

关键观点4: 肿瘤微环境的复杂性

细胞间通讯分析表明,肿瘤微环境中的各种细胞都受到癌细胞释放的信号分子APP的影响。


文章预览

‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Spatial transcriptomics reveals unique metabolic profile and key oncogenic regulators of cervical squamous cell carcinoma”,这篇文章发表在 J Transl Med 期刊上,影响因子为6.1。 结果: ST分析揭示了CSCC LE和TC区域细胞的空间表达模式 通过Stereo-seq ST测序,分析了CSCC组织和正常组织(NOR)。正常宫颈组织取自盆腔肿块附近的区域。CSCC样品分别从LE和TC区域获得,并且这些样品是HPV阳性的(图1A)。作者整合了来自宫颈癌患者的已发表scRNA-seq数据,以帮助解释和优化Stereo-seq数据,用于进一步研究。作者分析的scRNA-seq数据包括CA和CSCC病例作为ST数据分析中细胞注释的参考(图1C)。尽管它们在细胞组成上存在差异,但该方法有助于表征细胞类型并鉴定CSCC组织内细胞类型的分布。在质量控制之后,作者获得了来自总共15,318个细胞和29,663个基 ………………………………

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