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2024年10月9日,诺贝尔化学奖被授予蛋白质设计先驱 David Baker,以及谷歌DeepMind的 Demis Hassabis和John Jumper,以表彰他们在计算蛋白设计和蛋白结构预测领域的巨大贡献。 (图片https://www.nobelprize.org/prizes/chemistry/2024/summary/) 我们知道,Alphafold3可以准确预测众多蛋白甚至蛋白-小分子、核酸复合物的结构,计算蛋白设计也已经被广泛应用于蛋白binder、酶、跨膜蛋白、变构蛋白等的设计。抗体作为蛋白质的一种特殊形式,在生物医药领域占据半壁江山,全球市场规模已达到数千亿美元。 AI蛋白结构预测、计算蛋白设计技术能应用于抗体吗?与其他蛋白相比,有什么不同之处?如何设计抗体? 抗体从头设计技术的成熟度如何?应用现状如何?发展前景如何? 本文简要总结了科迈生物3年来的工作成果,试图较为系统地回答上述问题。 对于AI蛋白结构预测和
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