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富集通路中的基因怎么可视化?来看看这4种方法吧~

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-09-19 08:00

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生信益站,一点就有益 ! 祝友友们天天开心,月月发 CNS~ 设我为🌟星标,每天就能第一时间看到推送啦~ ❝ 事情是这样的,有友友在问——如何 可视化 富集到 某些 通路中的基因 ,于是给大家 整理了几种常见的案例 ,希望能对您有所帮助~ 方法1——和弦图 参考文章:《 多个组合(logFC)的富集和弦图怎么画? 》 方法2——气泡+桑基图 参考文章:《 不P图,复现富集气泡+桑基组合图 》 方法3——网络图 参考文章:https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book/enrichplot.html 方法4——条形图 效果如下: 画图代码如下(记得加 载ggplot2、dplyr等包 )—— 数据整理 library (GOplot) data(EC) head(EC$david) ##   Category         ID                             Term ## 1       BP GO:0007507                heart development ## 2       BP GO:0001944 ………………………………

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