easybio—使用 CellMarker2.0 进行单细胞注释的 R 包

文章预览

生信益站，一点就有益 ！ 祝友友们天天开心，月月发 CNS~ 设我为🌟星标，每天就能第一时间看到推送啦~ easybio：使用 CellMarker2.0 进行单细胞注释的 R 包 ❝ easybio ——Comprehensive Single-Cell Annotation and Transcriptomic Analysis Toolkit. 引言 单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 使研究人员能够在细胞水平上研究生物活动，从而发现新的细胞类型并分析细胞间相互作用。然而，在 scRNA-seq 数据中注释细胞类型是一个至关重要且耗时的过程，其质量会显著影响下游分析。准确识别潜在细胞类型为发现新细胞群或识别已知细胞的新标记提供了宝贵的见解，可用于未来的研究。 虽然存在各种单细胞注释方法，但最常见的方法之一 是使用已知的细胞标记 。 CellMarker2.0 数据库是一个从已发表文章中提取的人工管理的细胞标记库，被广泛用于此目的。然而，它目前只提供了一个基 ………………………………