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Science正刊|蛋白质语言模型EVOLVEpro实现快速的定向进化

数据派THU  · 公众号  · 大数据  · 2024-12-08 17:00
    

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来源 :GenomicAI ‍ ‍ ‍ 本文 约1300字 ,建议阅读 7分钟 未来,EVOLVEpro有望在更广泛的领域中得到,推动蛋白质工程的进一步发展。 近期,Science正刊上Kaiyi Jiang等人发表了题为“Rapid in silico directed evolution by a protein language model with EVOLVEpro”的文章,开发了名为EVOLVEpro的高效的蛋白进化方法,它结合了蛋白质语言模型(PLMs)和回归模型,通过少量实验数据快速改进蛋白质活性。 EVOLVEpro通过主动学习的方式,在几轮迭代中就能显著提高了蛋白质的期望性质,如结合亲和力、催化效率和免疫原性。 该框架在多个蛋白质上进行了测试,包括RNA生产、基因组编辑和抗体结合应用,显示出比现有方法更高的改进幅度。 图1:EVOLVEpro的框架和工作原理 展示了EVOLVEpro方法的概述。  EVOLVEpro的核心是一个模块化设计,其中PLM编码蛋白质序列并将其映射到连续的潜在 ………………………………

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