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Science | ProtGPS预测蛋白亚细胞定位

CNS导读  · 公众号  ·  · 2025-02-07 23:59
    

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细胞内蛋白很多时候需要组装到不同的compartments来协作发挥功能[1],这些 蛋白进入不同 compartments的特异性 是关键问题。 近日,一项发表在Science的工作结合蛋白语言模型[2]来解析蛋白在亚细胞compartments特异性定位的“编码”, 预测蛋白定位 ;并进一步 设计蛋白“靶向”特定的 compartment ;以及分析 病理性变异对蛋白的 compartments分布的影响 [3]。 该模型,研究人员称之为- ProtGPS ,的主要原理是 “魔改”常规用于预测蛋白结构的语言模型 来 预测蛋白在亚细胞compartments的定位 [2], [3]。 该项工作涉及到的 compartments蛋白(粗体) [3]。 “魔改”蛋白语言模型来预测蛋白亚细胞compartments定位[3]。 通过 ProtGPS 进一步结合 马尔可夫链蒙特卡洛算法 (MCMC) [4]并同时考虑自然蛋白化学特性以及非有序性等信息,研究人员设计蛋白成功靶向核仁[3]。 ProtGPS结合MC ………………………………

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