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绘制时间依赖AUC折线图

灵活胖子的科研进步之路  · 公众号  ·  · 2024-07-02 00:11

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绘制时间依赖AUC折线图 最近有几个同学问时间依赖AUC折线图的画法。如下图 示例图片 这类图最常见的用法是预测模型类文章比较新模型与既往模型之间在诊断患者生存概率上AUC值得大小,这种AUC值当然是随着时间而改变的。以下分享一种比较容易的画法,也是我经常用的画法。画图的过程中还可以同时返回一个dataframe,这个dataframe包含画图所包含的数据。 教程原文地址:https://rdrr.io/cran/riskRegression/man/autoplot.Score.html 可以从参数中看到,比较关键的一步是之前构建Score.list对象 首先构建测试数据与Score.list对象 library(survival) library(tidyverse) library(riskRegression) set.seed(2022) d=sampleData(1000,outcome= "survival" ) nd=sampleData(1000,outcome= "survival" ) 测试数据展示 测试数据结构展示 sampleData函数不仅可以模拟二分类和生存资料,还可以模型竞争风险模型资料 #构建cox比例 ………………………………

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