Genome Biol丨江燕/刘赟团队揭示SETDB1在小鼠神经前体细胞中调控短散在核元件活性及染色质环构象的分子机制

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哺乳动物的基因组中，约40-50%的区域是由DNA重复序列构成的转座元件 （transposable elements, TEs） 【1, 2】 。在进化过程中，绝大部分TEs积累突变后活性缺失，或者在表观遗传的调控下处于静默状态 【3, 4】 。但是，一部分TEs仍然具有转录调控活性，在神经发育中发挥重要作用 【5, 6】 。作为TEs的一个重要类型，短散在核元件 （short interspersed nuclear elements, SINEs） 广泛分布在小鼠基因组中，并富集锌指蛋白CTCF （CCCTC-binding factor） 的结合位点，参与调控染色质空间构象 【7】 。然而，SINEs在神经发育过程中的作用及其调控机制尚不明确。 近日，复旦大学脑科学研究院 江燕 课题组与基础医学院 刘赟 课题组合作，在《基因组生物学》 （ Genome Biology ） 杂志上发表题为 SETDB1 regulates short interspersed nuclear elements and chromatin loop organization in mouse neural precursor cells ………………………………