不要简单的相信作者提供的表达量矩阵

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GEO（Gene Expression Omnibus）数据库是一个公共的基因表达量数据库，它收录了来自不同平台的高通量基因表达数据，包括Affymetrix、Illumina和Agilent等。每个平台都有自己的文件格式和数据处理流程，以下是对这三个主要平台的简要介绍： Affymetrix ： 平台特点 ：Affymetrix平台使用微阵列技术，每个探针对应一个特定的基因或转录本。 文件格式 ：Affymetrix数据通常以 .CEL 文件格式存储，这是一种二进制格式，包含了原始的荧光强度值。 数据处理 ：需要使用专门的软件（如Affymetrix Power Tools, dChip, or R/Bioconductor的 affy 包）来读取 .CEL 文件，并进行标准化和背景校正。 Illumina ： 平台特点 ：Illumina平台使用测序技术，可以提供单核苷酸多态性（SNP）和基因表达数据。 文件格式 ：Illumina数据以 .idat 文件格式存储，这是原始的图像强度数据。 数据处理 ：需要使用Il ………………………………