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5-甲基胞嘧啶(m 5 C)是一种普遍存在的RNA修饰,对基因表达调控至关重要。 然而,由于亚硫酸盐测序(BS-seq)过程中严重的RNA降解和序列复杂性降低,准确和敏感的m 5 C位点鉴定仍然具有挑战性。 2024年7月12日,北京大学伊成器、浙江大学 李笑雨共同通讯 在 Molecular Cell (IF=14.5) 发表题为“Base-resolution m5C profiling across the mammalian transcriptome by bisulfite-free enzyme-assisted chemical labeling approach”的研究论文, 该研究 报道了 m 5 C-TAC-seq , 一种不含亚硫酸盐的方法,结合了TET辅助的 m 5 C - f 5 C 氧化和选择性化学标记,因此可以通过 m 5 C 位点的预富集和C-to-T转变直接进行碱基分辨率的 m5C 检测 。 研究人员通过 m 5 C-TAC-seq ,全面分析了人类和小鼠细胞中的 m 5 C 甲基化组,确定了大量可靠的 m 5 C 位点。通过干扰潜在的 m 5 C 甲基转移酶,破译了大多数 m 5 C 位点的相
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