专栏名称: 生信钱同学
北京大学在读博士生,记录自己的学习日常🌞分享生信知识:如单细胞和空间测序、多组学分析、宏基因组、病理组学、影像组学等生物信息学、机器学习和深度学习内容🌬
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掌握不同的生信可视化方法还挺重要的,差别很大,代码分享

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-09-07 07:00

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BiocManager::install( "Nebulosa" ) install.packages( "ggrastr" ) library(Nebulosa) library(ggrastr) ggrastr::rasterize(Nebulosa::plot_density(seu, c( "CD11b" , 'CD4' , 'CD45' , "FOXP3" , 'CD3' , 'CD8' , 'CD68' ), size= 0.2 ), dpi= 300 ) 两种绘图方式,视觉效果上差别很大。 关键词: 单细胞    单细胞测序    生信分析    代码学习    代码分享    生物信息学    生物信息学笔记    生信分析思路    生信文章    可视化 绘图 近期推文: 代码挺全面的一篇文章,咱们的课题生信部分基因上都会设计到 上游分析必须要会linux吗,R语言从fastq到TPM,rpkm,count表达矩阵,一口气直接跑完 这个nature应该是目前最开源的吧,没有之一,代码详细的我都不知道该怎么介绍 ………………………………

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