代码分享|| 农学方向看过来！单细胞+空间最新发表Dev Cell浙大农学院樊龙江团队绘制水稻种胚单细胞时空图谱

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本次分享的文献是一篇 农学方向的单细胞+时空转录组的文献 ！！！俗话说，隔行如隔山，之前一直关注医学方向的领域，这次也来看看植物的世界吧！该论文利用空间和单细胞转录组测序技术， 首次构建了水稻种胚单细胞分辨率的空间转录图谱 ， 建立了水稻种胚单细胞水平的空间转录组分析流程 。 数据和代码 所有单细胞的原始数据： CNGBdb: CNP0004152 空间数据：Stereo-seq data， the Spatial Transcript Omics DataBase, STOmics DB: STT0000049 including the lassoed raw matrix,  filtered feature-spot matrix, FB stained images, and cell annotation information 代码存在于两个地方： https://github.com/YAOJ-bioin/REGSTA-script  或  Zenodo: https://doi.org/10.5281/zenodo.11115774 代码整理成了以下步骤： #################################################################### #####01cellposePrediction.txt ################################################### ………………………………