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Nat Commun | 灵敏度94%、特异性87%,基于游离RNA的深度生成式AI模型可检测早期肺癌及不同亚型

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-12-09 15:30
    

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肺癌的早期发现可以提高治疗的有效性和患者的存活率,但相关筛查依从性往往很低。以循环肿瘤DNA(ctDNA)为基础的液体活检对早期肺癌的敏感性较低(55%-57%)。虽然表观基因组分析利用DNA甲基化的细胞类型特异性或DNA片段化模式,提高了基于突变模式的总体敏感性,但由于DNA脱落有限,对早期和较小肿瘤的敏感性仍然很低。近期的表观基因组学研究报告了更高灵敏度的肺癌检测,但这种增益通常是以较低的特异性为代价。 癌症中RNA调控机制的整体破坏也可能导致正常组织中出现不常见RNA片段及其稳定性。2018年,美国加州大学旧金山分校的Hani Goodarzi团队发现了一种新的癌症小RNA,称为孤儿非编码RNA(oncRNA),它们是癌症特异性基因组重编程的结果。研究显示, oncRNA含量丰富、稳定,并由活的癌细胞主动分泌到血液中 ,这与ctDNA相反。 oncRNA的 ………………………………

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