Nature | 基于商用Nanopore实现长蛋白单分子序列分析

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蛋白的“单分子测序”将大幅拓展人们对细胞内蛋白各种变体与修饰的认知，从而帮助人们更深入理解生理病理机制，并带来新疗法[1], [2]。 近日，一项发表在Nature的工作基于商用的Nanopore （MinION平台） 实现了在长链蛋白 （长达数百氨基酸，合成的特殊序列蛋白） 准确检测氨基酸替换，以及翻译后修饰[2], [3]。 该方法的关键是： 1 .利用一种有蛋白解折叠和移位活性的酶-ClpX来帮助底物蛋白按照一级序列单方向通过纳米孔[4]； 2 .进一步通过引入ClpX不能 “抓牢” 的打滑序列 （Slip sequence） 来实现底物蛋白的待测序列在纳米孔的来回 “穿梭” （结合电压驱动的反向移位） ，从而实现重复测量，进而提高序列分析准确性[2]。 结合解折叠/移位酶与底物蛋白的标签（Slip sequence等）实现多次测量，提高特定序列蛋白氨基酸替换等分析的准确性[2]。 研究 ………………………………