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定量解构肿瘤微环境:创新算法DeSide助力多种肿瘤内细胞丰度的精准预测

学术经纬  · 公众号  · 医学  · 2024-11-12 08:05

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▎药明康德内容团队编辑    实体肿瘤内,除了癌细胞,还存在数量可观的血管内皮细胞、成纤维细胞,以及多种免疫细胞,如肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤浸润淋巴细胞等。大量研究表明, 不同类型细胞的比例,在多种癌症类型中与患者的病情进展密切相关 。因此, 精准量化肿瘤微环境中各类细胞的比例 ,不仅有揭示深入理解肿瘤的发生与发展规律,对优化癌症诊疗策略也具有重要意义。 日前,中国科学院深圳先进技术研究院 李雪飞 副研究员团队与香港浸会大学 田亮 副教授团队展开合作,开发了一种基于深度学习( De ep learning)与公开单细胞数据集( Si ngle cell)的解卷积算法( de convolution method) DeSide 。该算法能够较精确地 估算19种实体肿瘤中16种细胞类型的丰度 。相关研究成果发表于《美国国家科学院院刊》( PNAS )。 据研究人员介绍, ………………………………

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